Question5.新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)的變異。

SARS-CoV-2的基因大小為29.9 kb，平均每月發生2處突變。多數突變不會影響傳染性或致病性，但是持續傳播會增加免疫逃逸的幾率，或增加傳播的適應性機會。其中，刺突基因內的突變會影響感染能力和中和抗體的作用，因此需要關注。SARS-CoV-2的刺突蛋白由1,273個氨基酸組成，病毒表面富集三聚體。刺突蛋白的受體結合結構域(RBD)與細胞表面的ACE2結合后，弗林蛋白酶將其在R685 / S686之間裂解，形成S1和S2亞基。TMPRSS2在R815 / S816的S2'位點進一步切割S2亞基，以促進病毒膜融合。

ACE2受體結合域(RBD)位于S1亞基內，許多中和抗體可識別并與RBD結合。因此，該區域的氨基酸突變特別令人關注。刺突蛋白的D614G突變體在日本占主導地位。《細胞》雜志2020年9月的月刊中報道，比較了約100種刺突區域突變病毒株的感染性和對中和抗體的反應性后，發現D614G突變比原始菌株更具傳染性。

此外，據報道，諸如N234Q，L452R，A475V和V483A的突變對某些單克隆中和抗體的反應較弱。

文獻：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32730807/

值得注意的變異病毒珠被稱為VOI(感興趣的變種)，其中具有較強傳染性和致病性的被稱為VOC(關注的變種)。迄今為止被報道VOC出現在英國，巴西和南非。在英格蘭肯特郡大爆發病毒株B.1.1.7有23個突變，突變數比其他病毒株更多，在他的刺突基因中發現了9個突變。這個在英國流行的病毒株的突變，比在日本流行的D614G突變多了一個N501Y突變，該突變可增加人和小鼠的ACE2親和力。

文獻：https://www.cogconsortium.uk/news_item/update-on-new-sars-cov-2-variant-and-how-cog-uk-tracks-emerging-mutations/

刺突基因內的E484K突變體在南非和巴西流行，已經顯示出他們正在增強人類之間的傳播能力。日本的國立傳染病研究所也對其國內的突變進行監測，并公布了結果。

公布：https://www.niid.go.jp/niid/ja/diseases/ka/corona-virus/2019-ncov/10084-covid19-28.html

日本慶應義塾大學的一個研究小組采集了2020年8月和12月在日本出現E484K突變病毒株，發現它們不僅有從國外流入的，也有在日本國內發生突變的。英國的變異病毒株中也發現了E484K突變。增加了ACE2親和力的病毒不僅會增加人與人之間的傳播，而且還可以在短時間內在全身復制，它可能加重病情。流行病學研究表明，這些突變病毒株之間在加重疾病或致死率中沒有差異，但隨后研究的深入，有多篇文獻已經報道了英國突變病毒株的確增加了感染者的重癥化。據報道，英國突變病毒株的傳播能力最大可增加到1.7倍，而實際的傳播是按照時效復制的數量來測量的，戴口罩之類防護措施也降低了感染率。

文獻：https://science.sciencemag.org/content/early/2021/03/03/science.abg3055.full

本文共同作者

■WG長

寺嶋　毅(東京歯科大學市川総合病院 呼吸器內科)

■WGメンバー

【日本癌治療學會】

江藤正俊(九州大學大學院醫學研究院 泌尿器科學分野)

掛地吉弘(神戸大學大學院醫學研究科 食道胃腸外科)

調　憲(群馬大學大學院醫學系研究科 総合外科學講座肝膽膵外科分野)

西村恭昌(近畿大學醫學部 放射線腫瘍學部門)

藤原俊義(岡山大學大學院醫歯薬學総合研究科 消化器?腫瘍外科學)

【日本癌學會】

清野　透(國立がん研究センター 先端醫療開発センター)

高山智子(國立がんセンターがん対策情報センター がん情報提供部)

松尾恵太郎(愛知県がんセンター研究所 がん予防研究分野)

松岡雅雄(熊本大學生命科學研究部 血液內科)

三森功士(九州大學病院別府病院 外科)

【日本臨床腫瘍學會】

市原英基(岡山大學病院 呼吸器?アレルギー內科)

小林信明(橫浜市立大學附屬病院　呼吸器內科)

小山泰司(神戸大學醫學部付屬病院 腫瘍?血液內科)

姫路大輔(県立宮崎病院 內科)